深圳公租房不办理入户是否会扣房租，这个问题涉及到深圳公租房的租赁规定和政策。根据深圳公租房的相关政策，不办理入户并不会直接导致扣除房租。

首先，深圳公租房的租赁政策是为了解决低收入家庭的住房问题，提供经济实惠的住房选择。在申请公租房时，通常需要提供相关的身份和收入证明等材料，以符合租赁条件。一旦获得公租房的租赁资格，租户就有权利居住在该房屋中，并按照约定的租金进行支付。

其次，不办理入户并不会改变公租房的租赁关系。入户是指将户口迁移到所居住的房屋所在地，与公租房的租赁并没有直接关联。因此，即使不办理入户，租户仍然有权利居住在公租房中，并按照约定的租金进行支付，不会被扣除房租。

然而，需要注意的是，虽然不办理入户不会扣除房租，但如果租户违反了公租房的租赁规定，例如擅自转租、改变房屋用途等行为，就可能会面临被收回房屋或扣除房租等后果。因此，租户在居住公租房期间，应当遵守相关规定和政策，确保自己的权益得到保障。

综上所述：

深圳公租房不办理入户并不会导致扣除房租。公租房的租金是按照约定的标准进行支付，与是否办理入户没有直接关系。然而，租户应当遵守公租房的租赁规定和政策，避免违反相关规定导致不必要的纠纷和损失。

法律依据：

《深圳市公共租赁住房管理办法》第十一条规定：“承租人应当按照合同约定支付租金和物业服务费等费用。承租人未按照合同约定支付租金和物业服务费等费用的，出租人可以要求承租人限期支付；承租人逾期不支付的，出租人可以解除合同。”该条规定说明了租户应当按照合同约定支付租金等费用，否则可能会面临合同解除等后果。但并没有规定不办理入户会扣除房租。