开票软件年费计入“管理费用”科目。

详细解释如下：

1. 管理费用科目概述：管理费用是指企业为管理和组织生产经营活动所发生的各项费用，包括各种日常管理费用、税金及行政费用等。这些费用在企业经营活动中是必要的支出，用于维护企业的正常运转。

2. 开票软件年费性质：开票软件年费是软件使用费用的一部分，属于企业在使用相关软件时产生的年度维护费用。由于这种费用与企业的日常运营直接相关，因此应被视为企业的管理费用。

3. 具体记账处理：当企业支付开票软件年费的时候，应该直接记入“管理费用”科目下的相应子科目，如“软件服务费”或“技术服务费”。这样，企业可以在财务报表中清晰地反映出这一费用的支出情况，便于管理和分析。通过这种方式记账，也有助于企业更准确地核算成本和进行财务决策。

综上所述，开票软件年费应记入企业的“管理费用”科目。这是基于其作为企业运营中必要的管理费用的性质而定的。正确的记账处理有助于企业更好地管理其财务状况和进行决策。