免费医学生毕业后，应按照入学前签署的定向就业协议，到生源所在地县级卫生行政部门报到，由基层医疗卫生机构按照有关规定与之签订聘用合同，办理相关手续，实行合同管理。免费医学生在协议规定的服务期内，可在本省（县、市）农村基层卫生机构之间流动。免费医学生毕业后未按协议到基层医疗机构工作的，要按规定退还已享受的减免教育费用并缴纳违约金。按照规定，各县级卫生行政主管部门应优先安排免费医学生进行住院医师规范化培训，规培三年期间应计入免费医学生定岗服务期内。