南京理工大学下设13个专业学院，包括机械工程学院、化工学院、电子工程与光电技术学院、计算机科学与技术学院、经济管理学院、能源与动力工程学院、自动化学院、理学院、外国语学院、人文与社会科学学院、材料科学与工程学院、环境与生物工程学院及设计艺术与传媒学院。各学院致力于培养具备扎实专业知识和技能的人才，为学生提供了多样化的学习和实践机会。

学校还设有研究生院、继续教育学院和国际教育学院，旨在为不同层次的学生提供深造和职业发展路径。同时，南京理工大学与外部机构合作，共同创办了南京理工大学紫金学院和南京理工大学泰州科技学院，这两个独立学院分别专注于工程技术与管理、以及工程技术与人文社科领域。

在机械工程领域，南京理工大学机械工程学院具有深厚的教学和科研实力，为学生提供了先进的实验设备和实践平台。化工学院则专注于化学工程与技术的研究，致力于培养具备创新意识和实践能力的化学工程师。

电子工程与光电技术学院和计算机科学与技术学院是理工科中的重点学院，注重培养学生在电子、光学、计算机科学等领域的理论知识和实践技能。经济管理学院则为学生提供了经济学、管理学等领域的深入学习机会，培养具有综合管理能力的人才。

能源与动力工程学院、自动化学院、材料科学与工程学院、环境与生物工程学院、设计艺术与传媒学院等专业学院，分别在各自领域内有着丰富的教学和研究经验，为学生提供了广阔的学习和发展空间。南京理工大学通过这些学院的建设，形成了多层次、多学科协调发展的教育体系，为社会培养了一批又一批的优秀人才。