南京机电职业技术学院王牌专业有电气自动化、数控技术等，算是最好的一些专业，具体名单如下，如有变动，以学校最新公布信息为准。

教育部、财政部“提升专业服务产业能力”重点建设专业：电气自动化、数控技术

江苏省“十二五”高等学校重点建设专业（群）：机械制造专业群

江苏省高等职业教育高水平骨干专业：数控技术专业

江苏省高水平专业群：机械设计与制造专业群

南京机电职业技术学院是2006年4月成立，由南京机电产业（集团）公司举办的市属公办高等职业技术学院。学院位于麒麟科技创新园，下设机械工程系、电子工程系、信息工程系、自动化工程系、人文社科系和继续教育学院。学院坚持“立足企业、面向行业、服务社会”的办学理念，以培养创新性技术技能人才为目标，积极推行校企合作，建立“分层建设、分类培养”的校企合作机制，加强校内外实训基地建设，包括与中邮建技术有限公司、中兴软件技术有限公司、长安福特马自达发动机有限公司等企业的合作，以提高教学质量。