中专。根据查询南京医药中等专业学校相关信息显示，南京医药中等专业学校是全日制公办中等专业学校，由此可知南京医药中等专业学校是中专。南京市医药中等专业学校，隶属于南京市食品药品监督管理局，是一所专门为医药行业培养医药专业技术人才的全日制学校。