北京航空航天大学，简称北航，是中国航空航天领域顶尖学府，每年吸引着无数高分考生报考。北航的自动化学硕与专硕在多个方面存在差异。

首先，在考试科目方面，自动化学硕的数学和英语考试分别采用数学1和英语1，而专硕则采用数学2和英语2。从难度上看，数学1和英语1比数学2和英语2要高。

其次，录取分数线也是区分学硕和专硕的一个重要因素。学硕的录取分数普遍高于专硕。

此外，学制也是一个显著的区别。学硕学制为三年，而专硕则为两年半。

综上所述，自动化学硕与专硕在考试科目、录取分数线以及学制上都存在明显的区别。