畜牧站隶属于农业农村行政部门，属于事业单位范畴。

作为农村农业部的直属事业单位，全国畜牧总站具有正局级的规格，与之并行的是中国饲料工业协会，两者共享一套管理机构，使用两块牌子。其主要职责包括：全国畜牧业（涉及饲料、草业、奶业）的良种与技术推广，畜禽、牧草品种资源的保护与合理利用，畜牧业质量的管理与认证，草地改良与生物灾害的防治。作为国家级的技术支撑机构，全国畜牧总站（中国饲料工业协会）的业务归口管理单位为农业农村部的畜牧兽医局。