日语笔译二级的合格标准是总分60分。

如同英语考试一样，满分设定为100分，合格线则统一设为60分。日语笔译能力的评估分为综合考试与实务考试两部分，考生必须在两场考试中同时达到60分，才被视为合格，并有资格获得日语笔译二级的认证。若考生仅在其中一项考试通过，即便成绩未达标，整体评价仍视为不合格，且下次考试成绩不会予以保留。

因此，无论在准备综合考试还是实务考试时，考生都需全面均衡地掌握日语知识，确保在两项考试中均达到合格标准60分，以确保整体成绩达标，顺利通过日语笔译二级的考核。