试点本科与普通本科在毕业证、报考方式、学籍管理等方面存在明显差异。试点本科的毕业证即为自考毕业证书，其本质是自考助学的一种形式。当前，几乎所有高校都提供自考助学项目，但需注意的是，自考并不提供毕业院校，自考毕业证书上的公章来自省自考委，主考院校会在其上盖章。然而，并非所有参与自考助学的高校都是主考院校，是否为主考院校，可通过当地省招办公布的名单查询。

试点本科无需参加高考，也不需要填报志愿，没有学籍，只有考籍，毕业时不会获得报到证。仅能获得自考毕业证书，学位证书的获取还需通过学位英语考试考核，未通过则无法获得成人学士学位证书。而普通本科则必须参加高考，填报志愿，统一录取，需经省教育考试院认定确认，教育部也将注册学籍。

试点本科和自考本科均属于自考范畴，但试点本科按现行规定仅限于山东和江西，名称并非试点本科，山东称为高教自考在校生实践课程考核试点，江西则称自考综合改革试点。这两种试点仅限于本校在校生报考，意味着如果山东某高校开展试点本科项目，仅该校在校生有资格报考，这实际上是一种在校专科生通过自考途径获取本科学历的方式。自考本科则无此限制，任何个人皆可报名、注册考籍、准备复习并参加考试。