执业药师在医院是承认的。执业药师职业资格考试合格者，由各省、自治区、直辖市人力资源社会保障部门颁发《执业药师职业资格证书》。该证书由人力资源社会保障部、国家药监局与人力资源社会保障部统一印制，在全国范围内有效。