若销售货物时仅有发票而没有银行回单与转账支票存根联，应首先进行销售的会计分录处理。借方记应收账款，贷方记主营业务收入与应交税费-应交增值税(销项税额)。这一步骤是为了确认销售收入及相应的税金。

随后，当收到款项，具备银行回单及转帐支票的情况下，应进行一笔补录分录。借方记银行存款，贷方记应收账款。此步骤旨在记录实际收到的货款，平衡会计账目，确保款项收讫的准确性与完整性。

在实际操作中，若因各种原因未能及时获取银行回单或转账支票存根联，企业应尽快与银行及客户沟通，确保及时获取相关单据，以便完整进行会计分录处理。同时，企业应建立健全内控制度，加强对销售收款流程的管理，避免类似情况的再次发生，确保财务数据的准确与合规。

通过上述步骤，企业能够妥善处理在销售货物过程中可能遇到的特殊情况，确保财务报表的准确性和合规性。同时，建立健全的财务内控体系，对于预防和解决此类问题具有重要意义。