个人所得税申报错误已缴款的处理方法如下：

1、若个税已扣款但发现申报错误，纳税人可向税务机关申请退税或下月抵扣；

2、必须先向税务机关报告情况；

3、若税款多缴，可申请退税或抵扣；

4、申报错误需及时更正或作废，以免影响信用。

个人所得税的计算与申报：

1、个人所得税的税率表：根据不同的所得项目和金额，个人所得税有不同的税率表，如工资薪金所得适用的是累进税率表；

2、计算应纳税所得额：扣除各项免税收入、减除费用、专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额；

3、适用税率和速算扣除数：根据应纳税所得额确定适用的税率和速算扣除数，计算出应纳税额；

4、预扣预缴和年度汇算：个人所得税通常采取预扣预缴的方式，年度结束时进行汇算清缴，以确保纳税额的准确；

5、税务申报系统：纳税人需通过税务局指定的申报系统进行个人所得税的申报，包括填报相关信息和上传必要的附件。

综上所述，个人所得税申报出错并已缴款的情况下，纳税人应首先向税务机关报告错误，然后可以选择申请退税或在下月进行抵扣，并且需要及时更正或作废错误申报，以避免对个人信用产生不良影响。

【法律依据】：

《中华人民共和国税收征收管理法》

第三条

税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行；法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。