医师定期考核的时间计算，有一个明确的规定，即执业12年以上的医师，其考核年限是从获得执业医师资格证书开始计算的。这里需要注意的是，执业助理和执业医师虽都属于医疗行业从业者，但两者之间存在明显的职称差异。具体来说，执业助理指的是在取得医师资格证书前，在医疗机构中从事诊疗、护理等工作的人员。而执业医师则是在取得了医师资格证书，并经过了规定的考试和实习期后，才得以获得的职称。

执业助理与执业医师的区别在于，执业助理在工作期间并不能独立执业，其主要职责是配合医生完成诊疗和护理工作。而执业医师则拥有独立的执业资格，可以在医疗机构中独立开展诊疗工作。因此，在进行医师定期考核时，执业助理的时间并不能算作执业医师考核的时间。

此外，医师定期考核的时间计算是按照职称来划分的，执业助理在取得执业医师资格证书后，其工作年限才能算作执业医师的考核年限。这也就意味着，在取得执业医师资格证书前，执业助理的工作年限并不能算作执业医师的考核年限。因此，医师定期考核执业12年以上的时间，是从获得执业医师资格证书开始算起的。

综上所述，医师定期考核的时间计算是严格按照职称来进行的，执业助理的工作年限并不能算作执业医师的考核年限，只有在取得执业医师资格证书后，其工作年限才能算作执业医师的考核年限。因此，医师定期考核执业12年以上的时间是从获得执业医师资格证书开始算起的。

值得注意的是，执业助理在取得执业医师资格证书后，其工作年限才能算作执业医师的考核年限。这意味着，在取得执业医师资格证书前，执业助理的工作年限并不能算作执业医师的考核年限。因此，医师定期考核执业12年以上的时间，是从获得执业医师资格证书开始算起的。

从上述分析可以看出，医师定期考核的时间计算是严格按照职称来进行的，执业助理的工作年限并不能算作执业医师的考核年限。只有在取得执业医师资格证书后，其工作年限才能算作执业医师的考核年限。因此，医师定期考核执业12年以上的时间是从获得执业医师资格证书开始算起的。

综上所述，医师定期考核的时间计算是严格遵循职称划分原则的，执业助理的工作年限并不能计入执业医师的考核年限中，只有在取得执业医师资格证书后，其工作年限才能被纳入执业医师的考核年限。