合肥工业大学作为一所部属院校，专注于工科教育，其排名在安徽大学之上。而安徽大学则属于省属综合性大学，尽管在专业特色上不如合肥工业大学突出，但其知名度较高。工科专业的毕业生通常就业前景较好。

安徽大学位于省会城市，拥有更多的就业机会，这使得它在就业方面具有一定优势。相比之下，合肥工业大学宣城校区虽然位于宣城，但它只是合肥工业大学的一个分校。宣城校区与合肥本部在师资力量、毕业证书以及毕业待遇上并无显著差异。而且，由于其分数线略低，宣城校区的性价比更高。

综上所述，如果考生倾向于选择工科专业，合肥工业大学无疑是更好的选择，特别是考虑到宣城校区的分数线略低，可以提供更多机会。如果考生更看重综合类大学的教育质量和省会城市的就业优势，那么安徽大学将是一个不错的选择。