福建农林大学南平校区就是原来的福建林学院，座落于南平市西芹镇，距西芹镇2KM，距市区10KM，原来福建林学院人气旺，交通方便，每10分钟有一辆中巴从门口发往市区。经过这几年合并后，农林大南平校区逐渐衰败破落。

自2008年起，南平市政府与福建农林大学就恢复福建农林大学南平校区办学达成协议。为了解决用地不足问题，学校把南平校区的利用问题摆上议事日程。根据南平校区现况和可实际利用资源的配套情况，学校拟在今年5月前入驻500名学生，下学期开学时入驻全日制学生2000人。南平市政府理解和支持福建农林大学恢复南平校区办学的想法，并负责协调学校办学周边环境建设问题，为学校办学创造一个良好的外部环境。

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