福建工贸学校分为福州校区和厦门校区，两地在地理位置上存在显著区别。福州校区坐落在福州市中心，而厦门校区则坐落于厦门市中心。这不仅为学生提供了不同的学习环境，同时也为他们提供了多样化的选择。

在教学设施方面，福州校区和厦门校区各有特色。福州校区配备了更多的实验室和工作室，为学生提供了丰富的实践机会。而厦门校区则更注重与当地企业的合作，提供更多的实习和就业机会，使学生在学习期间就能接触到实际工作环境，为将来的职业生涯做好准备。

两个校区的专业设置也有所不同。福州校区更偏重于工程类专业，为学生提供了工程领域的学习机会。而厦门校区则更加注重商贸类专业，为学生提供了商贸领域的学习机会。这种差异为学生提供了广泛的专业选择，使他们可以根据自己的兴趣和职业规划进行选择。

综上所述，福建工贸学校的福州校区和厦门校区在地理位置、教学资源和专业设置上存在明显的差异，为学生提供了多样化的学习体验。