测控技术与仪器专业与控制科学与工程学科之间存在明显的界限。控制科学与工程学科涵盖广泛，包括自动化和控制科学与工程等，其研究生阶段细分为六个二级学科，分别是控制理论与控制工程、检测技术与自动装置、系统工程、模式识别与智能系统、导航、制导与控制以及企业信息化系统与工程。这些二级学科主要关注于理论研究和工程实践。

相比之下，测控技术与仪器专业隶属于国家教育部的仪器科学与技术学科，是一个独立的本科专业。这个专业的核心在于测量与控制技术的结合，培养能够从事测量仪器、控制系统设计与开发的高级工程技术人才。因此，测控技术与仪器专业侧重于实际应用和技术开发，而不是深入的理论研究。

简而言之，控制科学与工程学科更注重理论和系统层面的研究，而测控技术与仪器专业则聚焦于具体的技术应用和实际操作。两者的区别在于研究深度和应用范围的不同，控制科学与工程学科为更广泛的工程领域提供理论支持，而测控技术与仪器专业则致力于解决具体的技术问题。