贵州省内的医学高等教育机构，遵义医学院和毕节医学高等专科学校备受关注。

根据2019年教育部的学科评估，遵义医学院在医学专业本科排名中位于第68位，毕节医学高等专科学校则位于第166位。遵义医学院作为一所本科院校，其学科专业相较于毕节医学高等专科学校更加广泛，更有助于学生获得硕士、博士学位。因此，遵义医学院在医学教育领域的声誉和实力更强，选择医学院校时，遵义医学院无疑更占优势。

从学科评估成绩来看，遵义医学院的专业排名更为靠前，表明其在医学教育领域具有更强的实力和更高的声誉。同时，作为本科院校，遵义医学院提供的专业范围更广，为学生提供了更多元化的学习选择和更高的学历提升途径。相比之下，毕节医学高等专科学校在专业排名和学历提升方面的优势较小。

综上所述，虽然毕节医学高等专科学校在贵州省内的医学教育领域有一定的地位，但与遵义医学院相比，遵义医学院在专业排名、学科范围以及学历提升方面更具有优势。因此，在选择医学院校时，遵义医学院应为更佳选择。