厦门市思明区教育局。根据查询搜狐网和百度地图信息显示，截止到2023年8月29日，集美、海沧、同安、翔安辖区内初中招生工作由所在区教育局负责组织，岛外市直属校初中招生办法由市、区教育局商定，福建省厦门第二中学位于厦门市思明区鼓浪屿街道，所以隶属于思明区教育局。