南京大学和浙江大学在考古学及博物馆学研究生入学难度方面，南京大学的考取门槛似乎更高。这并非因为浙江大学的阅卷过程过于严格，而是南京大学的历史学学科整体实力较强。

南京大学拥有博士后流动站，而浙江大学直到2011年才获得历史学一级学科博士点。在新的学科划分体系下，浙江大学的考古学博士点存在疑问，其在考古学领域的研究实力可能较南京大学有所差距。

因此，从学科建设和师资力量的角度出发，南京大学在考古学及博物馆学研究生教育方面可能更具优势，使得其考取难度相对较高。然而，浙江大学在其他领域如工科、计算机科学等也有显著表现，各有侧重，考生应根据自己的兴趣和特长进行选择。