厦门市工商行政管理局的主要职责包括执行国家工商行政管理法规和政策，制定并实施地方性法规和规章。其首要任务是负责市场监督管理和行政执法，确保各类企业、农民专业合作社、个体经营者及外国企业常驻代表机构等主体的合法登记与监管，打击无照经营行为。

该局还负责规范和维护市场经营秩序，对市场交易行为和网络商品交易进行监督，确保商品质量和食品安全，保护消费者权益，处理消费者咨询、申诉和举报。此外，打击直销和传销违法行为，监督直销企业和直销员活动，以及查处不正当竞争、商业贿赂等经济违法行为。

在合同管理方面，厦门市工商行政管理局负责实施合同行政监督，管理动产抵押物登记和拍卖行为，查处合同违法行为。广告业的发展也受其指导和监管，商标保护和管理工作同样重要，包括商标专用权保护和侵权行为查处，以及著名商标的认定和保护。

此外，该局还负责企业、个体工商户和市场的信用分类管理，发布相关市场信息，为政府决策和社会公众提供服务。对于私营企业及个体工商户的经营行为，提供指导和服务并进行监督管理。同时，协调全市对市场中介机构和执业人员的信用信息管理。

最后，厦门市工商行政管理局受市委、市政府垂直管理，并处理其他交办事项。