南京大学物理学院是中国物理学及其交叉科学研究、人才培养和国际学术交流的重要基地。下设现代物理系、物理学系、光电科学系、声科学与工程系和基础物理教学中心，形成学科优势。

学院的物理学国家一级重点学科，理论物理学、凝聚态物理、声学等3个国家二级重点学科，使学院学科布局突出。在2007-2009年教育部评估中，南京大学物理学一级学科排名全国第一。学院拥有固体微结构物理国家重点实验室（National Laboratory of Solid State Microstructures），是南京微结构国家实验室（筹）的学术主体。学院还建有近代声学教育部重点国家实验室、江苏省高技术研究重点实验室（纳米技术），以及十余个跨学科研究所和研究中心。

自1999年国家奖励制度改革以来，物理学院获得多项国家自然科学一等奖、国家自然科学二等奖和国家科技进步二等奖，数量在全国高校物理学院系中最多。学院重视本科生教育，以“依托重点学科，教学科研结合，培养创新人才”为办学特色，致力于培养具备强烈竞争力的优秀物理学基础型和应用型人才。学院是国家物理学基础学科人才培养基地，大学物理教学实验中心是国家物理学基础学科人才培养基地和国家物理实验教学示范中心。