复旦大学MBA学费根据项目和学制而有差异。非全日制的复旦MBA项目为期2.5年，学费总计49.98万元。全日制的复旦国际MBA项目与MIT合作，学制2年，学费为36.98万元。对于留学生和港澳台学生，学费也有所区分。留学生MBA项目学制2年，学费41.98万元；港澳台MBA项目学制2.5年，学费同为41.98万元。