南京农林类大学排名中，南京农业大学和南京林业大学位列前茅。南京农业大学位于江苏省南京市，是中华人民共和国教育部直属的重点大学，双一流、211工程、985工程优势学科创新平台重点建设高校。南京林业大学同样位于江苏省南京市，由国家林业和草原局与江苏省人民政府共建，是“双一流”建设高校，以林科为特色，以资源、生态和环境类学科为优势的多科性大学。

南京农业大学前身可追溯至1902年三江师范学堂农业博物科和1914年金陵大学农学院。在1952年的全国高校院系调整中，原国立中央大学农学院、金陵大学农学院以及浙江大学的部分农学类系科合并，成立了南京农学院。1963年，南京农学院被确定为全国重点大学，1984年更名为南京农业大学。南京农业大学在全国高校中占据重要地位，不仅入选111计划、2011计划、高等学校创新能力提升计划、高等学校学科创新引智计划、基础学科拔尖学生培养试验计划、卓越农林人才教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、教育部教育援外基地、国家大学生文化素质教育基地、国家理科基础科学研究和教学人才培养基地，还是“双一流”农科联盟、高水平行业特色大学优质资源共享联盟、CDIO工程教育联盟成员单位、全国乡村振兴高校联盟副理事长单位。

南京林业大学则以中央大学森林系和金陵大学森林系为前身，1952年合并组建南京林学院，是中国当时仅有的三所高等林业院校之一。1955年华中农学院林学系并入，1972年更名为南京林产工业学院，1983年恢复南京林学院名称，1985年更名为南京林业大学。南京林业大学同样在教育领域取得了显著成就，入选了国家首批“卓越农林人才教育培养计划”、国家“特色重点学科项目”建设高校、“国家建设高水平大学公派研究生项目”、“国家大学生文化素质教育基地”、“国家级大学生创新创业训练计划”、江苏省“2011协同创新中心”、江苏省“卓越工程师教育培养计划”。