南京的本科院校有：

1. 南京大学

2. 东南大学

3. 南京航空航天大学

4. 南京理工大学

5. 南京师范大学

6. 南京邮电大学

7. 南京医科大学

8. 南京林业大学

9. 南京财经大学

10. 南京审计大学等。

解释：

南京大学：南京大学是江苏省南京市的一所综合性重点大学，是中国顶尖的高等学府之一。

东南大学：东南大学位于南京市，是一所历史悠久、实力雄厚的多学科性工业大学。

南京航空航天大学：该校是工业和信息化部直属的一所航空航天类高校，在南京享有很高的声誉。

南京理工大学：南京理工大学是一所以工为主，理、管、文等多学科协调发展的全国重点大学。

南京师范大学：南京师范大学是江苏省重点建设的师范类高校，在教育学科领域有着很高的学术声誉。

除了上述高校，南京还有多所其他本科院校，如南京邮电大学、南京医科大学、南京林业大学等，这些学校在不同的学科领域都有很好的表现。南京的本科院校数量众多，为广大学子提供了丰富的教育资源选择。这些学校不仅为南京培养了大量优秀人才，也为国家的建设和发展做出了重要贡献。