琼州学院三亚校区将开设多个专业院系，包括理工学院、教育科学学院、电子信息工程学院、旅游管理学院、人文社科学院、教育部教育援外基地、生物科学与技术学院、继续教育学院和体育学院。这些院系中，教育科学学院和生物科学与技术学院的新生目前仅在三亚校区学习，预计在大二时返回五指山校区。而体育学院虽然总部仍在五指山，但新生在三亚学习，据说总部也有可能搬迁至三亚。

目前，人文社科学院是琼州学院规模最大的学院。教育科学学院和生物科学与技术学院的建设工作正在进行中，继续教育学院主要针对成人教育和函授等项目。

关于搬迁的具体情况，有消息称新生可能仅在三亚校区待一年后回到五指山校区，但具体的搬迁计划和时间表尚未公布。此外，教育部教育援外基地正处于建设阶段，尚未全面投入使用。

三亚校区的开设旨在为学生提供更好的教育资源和更丰富的学习环境，同时也为三亚市的经济发展和人才培养贡献力量。随着各项工作的推进，三亚校区将逐步完善，为学生创造一个更加优越的学习和生活环境。