内蒙古医科大学位于首府呼和浩特市，原为内蒙古医学院，其在首府的优势显著，但预防医学专业水平有待提升。

包头医学院座落于包头市，名称多次更迭，曾是内蒙古科技大学的一部分，目前以独立的办学机构形式存在。

内蒙古民族大学位于通辽市，设有医学院，为学生提供了多样化的学习机会。

赤峰学院设于赤峰市，同样拥有医学院，致力于培养口腔医学及其他医学专业人才。

河套大学在巴彦淖尔市设立，设有医学系，包含护理与康复等专业，为学生提供全面的医学教育。

鄂尔多斯应用技术学院位于鄂尔多斯市，设有医学系，提供专科层次的口腔医学教育。该系实质上隶属于内蒙古医科大学鄂尔多斯学院，即鄂尔多斯卫生学校。