南平地区仅有一所本科大学，即武夷学院。该校位于“世界文化与自然遗产地”——武夷山，地处海峡西岸经济区的绿色腹地。学校于2007年3月19日，经教育部批准设立，成为一所全日制公办本科院校。武夷学院是全国第二批深化创新创业教育改革示范高校。

武夷学院的前身可以追溯至1958年8月12日成立的南平师范高等专科学校。1962年1月，福州师范专科学校并入，更名南平师范学院。在文革期间，学校停办。1978年，经国务院批准复办，随后在1980年改名为南平师范专科学校。1994年，学校改名为南平师范高等专科学校。2007年，该校升格为本科院校，并更名为武夷学院。2018年，武夷学院被列为福建省2018-2020年硕士学位授予培育单位立项建设名单。