南京地区拥有本科层次与专科层次教育的院校丰富多样。其中，包含专科教育的本科院校有南京大学、东南大学、南京理工大学、南京航空航天大学、河海大学、南京师范大学、南京财经大学、南京邮电大学、南京农业大学、南京工业大学、中国药科大学、南京审计学院、南京医科大学、南京林业大学、南京中医药大学、南京气象学院、南京晓庄学院、南京艺术学院、南京工程学院等。

而专门的专科院校则有江苏海事职业技术学院、南京工业职业技术学院和江苏经贸职业技术学院，这些学院专注于提供专科层次的教育，为学生提供专业技能和基础学科的学习。