一类大学：

- 31所副部级高校：副部级。

二类大学：

- 除上述外二本以上：正司级；因此，二类大学校长和书记是厅、司、地级级别的官。

目前全国有31所大学是副部级，即：

- 北京大学

- 清华大学

- 中国人民大学

- 北京理工大学

- 北京航空航天大学

- 北京师范大学

- 中国农业大学

- 哈尔滨工业大学

- 复旦大学

- 上海交通大学

- 中国科学技术大学

- 西安交通大学

- 西北工业大学

- 浙江大学

- 南开大学

- 天津大学

- 南京大学

- 武汉大学

- 四川大学

- 中山大学

- 吉林大学

- 厦门大学

- 大连理工大学

- 山东大学

- 同济大学

- 华中科技大学

- 东南大学

- 中南大学

- 重庆大学

- 兰州大学

- 西北农林科技大学。

另外，国防科大是副大军区级（相当于副部级）。

这些高校的校长、书记等高层领导由中央组织部任命而非教育部任命。一般在学校介绍中说“中央直管”，就是副部级大学，也称副部级高校、中央直管高校等。

另外，清华大学领导级别如下：

- 副部级：党委书记、校长

- 正局级：党委常务副书记、常务副校长

- 副局级：党委副书记、常委

- 常委、副校长、教育长、总务长、秘书长

- 正处级：各学院的分党委书记和院长，党委行政直属部门正职，教辅单位书记、主任。