上海海关高等专科学校专注于海关相关领域的教育，其专业设置涵盖了多个领域。港口运输类专业如报关与国际货运，致力于培养具备国际物流知识与技能的专业人才。在财政金融领域，学校设有税务财务会计类专业，旨在培养能够在税务和财务管理方面发挥作用的专家。审计实务专业则关注培养学生在审计领域的实际操作能力。

工商管理类中的物流管理专业特别设置了国际物流与海关监控方向，这为学生提供了深入了解国际物流运作以及海关监管机制的机会。公共管理类下的海关管理专业则注重培养能够胜任海关管理工作的人才。在语言文化类中，应用英语（经贸英语方向）专业为学生提供了国际贸易和经济领域所需的英语技能。

法律实务类中的法律事务专业则致力于培养具备法律知识和实践能力的专业人才，他们能够在法律领域内提供专业的服务和支持。这些专业设置旨在全面培养学生的知识和技能，使其能够应对海关及相关领域的复杂挑战。

作为我国唯一一所专注于海关教育的高等专科学校，上海海关高等专科学校的专业设置充分体现了其在这一领域的专业性和独特性。学校通过多样化的课程设置，为学生提供了广阔的学习和发展空间。