南京地区的四所知名学府——南京中医药大学、南京信息工程大学、南京林业大学以及南京工业大学，各有特色与亮点，具体比较需从不同维度分析。

首先，从办学层次和国际化认可度来看，南京中医药大学、南京信息工程大学、南京林业大学均被纳入双一流建设高校，相较于南京工业大学，这些大学在办学层次上具有一定的优势。南京信息工程大学在国际四大权威大学排名中表现尤为突出，平均排名全国第58位，展现了其在综合教育质量与学科建设上的领先地位。

其次，高考录取分数是衡量学生竞争能力的重要指标。以2019年江苏省高考理科录取分数线为例，南京信息工程大学以364分的录取分数居首，紧随其后的是南京中医药大学（375分）、南京审计大学（362分）以及南京工业大学、南京林业大学（均为359分）。由此可见，南京信息工程大学在高考录取分数方面具有明显优势。

综合院校排名来看，南京信息工程大学在各项排名中均展现出较高的竞争力，尤其是在大气科学、计算机科学、电子信息工程等专业领域，其排名位于世界前列。南京工业大学的化工专业亦是其优势所在，师资力量强大。南京审计大学的审计学专业在全国具有领先地位，而南京中医药大学在中医药学领域享有盛誉，南京林业大学的林业专业也颇具特色。

综上所述，南京地区的这几所大学各具特色，南京信息工程大学在国际化排名和多个专业领域表现出色，而南京中医药大学、南京林业大学和南京工业大学在各自领域内也有着显著的学术地位和专业实力。选择哪所大学，应根据个人兴趣、专业需求以及分数等因素综合考量。