建水三中教学质量较好一些，建水六中对于特长生较好一些。

1.建水三中办学历史悠久，从1880年开办“慈云书院”到至今的建水县第三中学已有一百多年的历史。教师队伍师德高尚，素质精良。学校一贯坚持“全面推进素质教育，全面提高教学质量”的办学方向，从实际出发，狠抓师德师风建设，狠抓教师业务能力提高，狠抓教育科研和教学质量的提高，深化改革，强化管理，形成了良好的校风、班风、学风。学校，校舍建筑面积15564平方米。教学设施齐全，有各种功能室和运动设施，现拥有的卫星教育接收系统、校园电视广播系统、校园局域网等教学装备更提升了学校办学的水平。

2、建水六中创办于1977年，1996年首批被认定为“云南省二级一等完全中学”。2005年8月，在县委、政府的统筹下，搬迁至县城北部新区，剥离初中，成为一所高级中学。学校占地152.5亩，布局合理，教学设备齐全，环境优美，属于花园式学校。“特长育人，质量立校”是建水六中的办学思路，学校注重抓好音乐、舞蹈、美术、体育、书法特长生的培养，注重发挥艺体特长的龙头作用，让音乐、舞蹈、美术、体育、书法特色办学得到全面均衡的发展，培养了大批的体育和艺术人才，在县内乃至州内产生了巨大的社会影响。