自1957年起，南山中学经历了四十五年的风雨历程，逐步发展成为如今的知名学府。这段历程可以划分为三个关键阶段：

第一阶段，1957年至1968年，学校为南山农业中学，最初位于官坊村。1960年经济困难时期，学校迁至现址附近，尽管条件艰苦，仍坚持办学，因此受到上级的高度重视，成为福建省重点农业中学，1964年更是被评为福建省半农半读先进学校。1969年，学校迁至南山村的香光寺进行新校建设。

第二阶段，1968年至1981年，学校改名为南山“五七”中学，后成为初级中学，1972年开始招收高中学生。这一时期，学校为国家输送了大量人才，1979年被评为龙岩地区唯一的农村中学先进学校。

进入第三阶段，1981年至今，学校正式定名为南山中学，初中和职高并存。1981年至1997年，职高教育蓬勃发展，成为省级重点职高。近年来，初中教育成绩斐然，累计获得各级奖励48次，其中包括连续六年的县中考综合评估“六连冠”。2006年，学校再次创造辉煌，蝉联“中考综合评估居全县农村中学第一名”荣誉。学校荣誉不断，先后荣获市级课改基地校、素质教育先进校、文明学校以及省先进党政工共建之家等称号。这些成就的取得，正是源于坚持不懈的努力和时代变迁的推动。