根据济宁高新区经济发展局和济宁高新区发展软环境保障局的《关于济宁孔子国际学校收费标准的批复》（济高新经发收费〔2020〕2号），学校按照不同年级和班级类型制定了相应的学费标准。具体来说，小学部实验班的学费为每年20000元，国际班和淑女班的学费则为35000元。初中部实验班和博慧班的学费为24000元，而国际班的学费则更高，达到46000元。对于高中部，实验班的学费为36000元，国际班和西班牙语班的学费则为56000元。

此外，学校还设置了住宿费，每年为2000元。这些费用标准是基于学校的具体情况，包括办学水平、办学成本以及市场需求等因素综合确定的。

值得注意的是，根据山东省发改委、山东省财政厅、山东省教育厅和山东省人力资源和社会保障厅联合发布的《关于印发山东省中小学收费管理办法的通知》（鲁发改成本〔2020〕648号），山东省对于非营利性民办中小学的学费和住宿费采取了政府指导价的管理方式。这意味着学费和住宿费的具体数额需要综合考量学校自身的教育质量、运营成本以及社会需求等多方面因素。