日本东京理科大学在专业设置上，提供多元化的学科选择，以满足学生不同的学术兴趣与职业规划需求。学校采用学部略称表示，便于师生间沟通与理解。

在数学科领域，学校设有S科，致力于培养数学领域的专业人才，深入研究数学理论与应用。

物理学科方面，B科作为主要学习单位，旨在通过系统性教学与实践，培养物理科学领域的研究与创新能力。

数理情报科学科(SJ科)的设立，旨在结合数学与信息技术，培养能够在大数据时代中发挥关键作用的专业人才，为未来科技发展提供强有力的支持。

在工程技术领域，OB科与OK科分别聚焦于应用物理与应用化学，通过实践与理论结合的教育方式，培养具备解决实际问题能力的工程技术人才。

东京理科大学的专业设置注重跨学科融合，旨在培养具备全面素养、创新能力与实践能力的优秀人才，为社会的发展与进步贡献智力资源。