农民专业合作社在运营过程中应遵循以下原则：

1. 自愿互利：合作社的成立和运作应基于成员的自愿参与，确保每位成员从中获得实际利益，实现互助合作。

2. 民主管理：合作社的管理应体现民主原则，通过成员大会和理事会等机构，让每位成员在决策中有发言权，确保管理的透明和公正。

3. 公平公正：合作社在经营活动中必须公平对待所有成员，避免任何形式的歧视，维护市场秩序和公平竞争。

4. 可持续发展：合作社应注重环境保护和资源可持续利用，推动农业生产和生态环境的和谐发展。

5. 创新发展：合作社应积极探索创新，引入新技术、新品种、新设备，促进农业现代化和提升产品质量。

在实施这些原则时，合作社应结合本地实际情况和成员需求，制定具体可行的规章制度，并确保这些原则得到有效执行。此外，合作社还应寻求与相关农业机构、*部门、金融机构等的合作，以加强农业发展和乡村振兴的支持。