中华人民共和国铁道部财务司的主要职责包括制定国家铁路的财务会计规则和管理措施，如运输收入清算规定。其工作内容涵盖指导部属单位的财务管理活动。

在政策建议方面，财务司研究并向国家报告关于铁路运价、税收、财政、信贷和金融领域的策略，同时协调相关的实施工作，确保政策的有效执行和协调。

在资金管理上，财务司负责铁路建设基金的收缴、拨付和预算决算过程，确保资金的合理运用和监管。这涵盖了国家铁路各类资金的筹集、分配以及使用情况的监督。

在资产管理方面，财务司承担着国有铁路资产的监管职责，致力于建立和实施产权制度，实行资产经营责任制。他们组织财会检查，保护国家对铁路投资的权益，维护财经纪律，并负责国家铁路货车资产价值的管理工作。