复旦大学化学系的毕业生在就业方面拥有广泛的选择。他们可以选择继续深造，攻读硕士或博士学位，并在国内外著名大学和研究机构从事化学及相关领域的研究和教学工作。

此外，毕业生也可以加入化学及相关行业，如石油、化工、制药、生物技术、材料、环境等，从事研发、生产、分析、管理等工作。他们还可以在教育和培训机构，如中小学、高校、培训机构等，从事化学教育、科普推广等工作。

对于有志于进入政府部门工作的毕业生来说，复旦大学化学系为他们提供了报考公务员的机会，他们可以进入环保、质监、海关、商检等政府部门，或在企事业单位从事化学相关管理工作。

同时，复旦大学化学系毕业生也可以选择进入交叉领域，将化学与其他领域相结合，如金融、IT、人工智能、管理等，发展多元化职业生涯。他们还可以利用化学专业知识开展创业活动，为社会创造财富。

值得注意的是，以上毕业去向并非绝对，复旦大学化学系毕业生可以根据自己的兴趣、能力和职业规划选择适合自己的发展道路。