圣方济各堂区是澳门特别行政区众多堂区之一，它并非正式的行政机构，不具备法律地位。位于路环岛这一地理位置上，它曾在历史的葡萄牙统治时期隶属于澳门海岛市，即Concelho das Ilhas，也被称作海岛市政区。在那个时期，澳门海岛市是葡萄牙在澳门设立的两个城市之一。然而，随着1999年澳门的回归，原有的市级行政区划被撤销，圣方济各堂区的角色也随之发生了变化，成为行政非法定的区域。

在澳门的行政区划中，除了圣方济各堂区，还有花地玛堂区、花王堂区、望德堂区、风顺堂区和大堂区等多个区域，它们共同构成了澳门特别行政区的版图。每个堂区都有其独特的文化历史背景，反映了澳门的多元风貌。如今，圣方济各堂区虽不再具备行政权力，但作为澳门历史和文化遗产的一部分，它依然保持着其独特的地位和影响力。