香港中文大学（深圳）本科招生专业包括市场营销、国际商务、经济学、金融学、会计学、数学与应用数学、新能源科学与工程、化学、电子与计算机工程、物理学、应用心理学、翻译、英语等。各学院具体专业设置如下：

经管学院设有市场营销、国际商务、经济学、金融学、会计学。

理工学院设有数学与应用数学、新能源科学与工程、化学、材料科学与工程、电子与计算机工程、物理学（拟新增）。

人文社科学院设有应用心理学、翻译、英语。

数据科学学院设有统计学、计算机科学与技术、数据科学与大数据技术。

医学院设有临床医学、生物信息学、生物医学工程、药学、生物科学。临床医学专业学制六年，旨在培养具备专业医学知识与临床技能、兼具国际视野和人文情怀的世界一流医学创新人才。

经管学院、理工学院与数据科学学院联合培养金融工程专业。

音乐学院设有音乐表演、音乐学、作曲与作曲技术理论。

香港中文大学（深圳）是按照《中外合作办学条例》设立，传承香港中文大学办学理念和学术体系的大学，为广东省高水平大学重点学科建设高校。学校采用理事会领导下的校长负责制，积极探索有中国特色的现代大学制度，具有国际化氛围、中英并重的教学环境、书院制传统、通识教育、新型交叉学科设置和以学生为本的育人理念。