贵州中医药大学有继续教育学院、马克思主义学院、外语教学部、基础医学院、药学院、人文与管理学院、护理学院、针灸推拿学院、骨伤学院、体育健康学院（体育部）等学院。

学校设置包括：继续教育学院、马克思主义学院、外语教学部、基础医学院、药学院、人文与管理学院、护理学院、针灸推拿学院、骨伤学院、体育健康学院（体育部）和中医养生学院、第一附属医院（第一临床医学院）、第二附属医院（第二临床医学院）、信息工程学院。

贵州中医药大学是贵州省人民政府举办的全日制普通高等学校，由国家中医药管理局和贵州省人民政府共建，是卓越中医师教育培养计划改革试点高校及贵州省重点支持建设高校。学校始建于1965年，最初由贵阳医学院祖国医学系、贵州省中医研究所、贵州省卫生干部进修学校和贵阳市中医医院合并而成贵阳中医学院。2001年，贵州省中医研究院和贵州省中药研究所合并组成贵州省中医研究院，整体并入贵阳中医学院。2002年，滇黔桂石油技工学校被划归贵阳中医学院。2018年12月，学校正式更名为贵州中医药大学。